Il est très important de préciser que le principe de compensation ne doit intervenir qu'en ultime recours, afin que les auteurs portant atteinte à la biodiversité ne s'imaginent pas pouvoir s'acheter des indulgences. Un récent rapport de l'IUCN, la plus importante institution internationale pour la conservation de la nature, révèle que 756 espèces sont en danger d'extinction et que 85 ont d'ores et déjà disparu depuis son rapport de 2002. Comment « compenser » la disparition d'une espèce ? Un rapport de la Fondation Nicolas Hulot, lui, montre que le taux d'extinction actuellement observé est mille fois supérieur à l'extinction naturelle des espèces, ce qui est bien la preuve qu'il résulte de l'activité humaine.