La branche Île-de-France de la FNAUT regroupe à la fois des adhérents individuels et collectifs. Son objectif est de contribuer à l'amélioration des transports publics, qu'ils soient ferroviaires ou routiers, notamment en termes d'environnement et d'accessibilité. À ce titre, elle participe à de nombreuses instances, dont les comités de ligne, ainsi qu'à tous les débats et enquêtes publics.