Le médecin scolaire participe à l'accueil de la famille, bien souvent à l'annonce du handicap, et construit avec l'enseignant référent un projet personnalisé de scolarisation. Ce travail en amont permet de transmettre à la maison départementale des personnes handicapées une proposition de scolarisation spécifique. C'est la maison départementale des personnes handicapées qui décide des attributions particulières, notamment en termes de moyens humains comme les auxiliaires de vie scolaire. L'accompagnement des enfants malades ou handicapés représente une part importante du travail du médecin de l'Éducation nationale.