Cette démarche est coordonnée avec l'initiative en faveur des investissements d'avenir dans les universités, grâce aux contrats signés avec les établissements publics de coopération scientifique et avec les établissements publics d'enseignement supérieur et de recherche. Le ministère veille à assurer la cohérence entre les projets d'excellence et les contrats signés avec l'État.