C'est pourquoi il convient maintenant d'unifier les modes d'exploitation du RER, qu'ils relèvent de la RATP ou de la SNCF.
En ce qui concerne les péages liés aux lignes à grande vitesse, l'État n'assume pas entièrement la part du financement prévu à sa charge du réseau ferroviaire, ce qui conduit RFF à s'endetter davantage compte tenu du déficit continu.