La généralisation des logiciels d'aide à la prescription mettant en oeuvre des protocoles thérapeutiques et intégrant la dimension médico-économique donnerait une cohérence à l'ensemble du dispositif. Dans son récent rapport concernant la prescription, la consommation et la fiscalité des médicaments, la MECSS préconise que ces dispositifs soient opérationnels au plus tard dans un an.